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Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  31 lines
  1. *******************************************
  2. * Dihydroorotate dehydrogenase signatures *
  3. *******************************************
  4.  
  5. Dihydroorotate dehydrogenase  (EC 1.3.3.1)  (DHOdehase)  catalyzes  the fourth
  6. step in   the   de   novo   biosynthesis  of  pyrimidine,  the  conversion  of
  7. dihydroorotate into orotate. DHOdehase is a ubiquitous FAD flavoprotein.
  8.  
  9. In bacteria  (gene pyrD), DHOdease  is  located    on  the  inner  side of the
  10. cytosolic membrane.  In some yeasts, such as in Saccharomyces cerevisiae (gene
  11. URA1), it is a cytosolic  protein while in other eukaryotes it is found in the
  12. mitochondria [1].
  13.  
  14. The sequence  of  DHOdease  is rather well conserved and we have developed two
  15. signature patterns  specific to this enzyme. The first corresponds to a region
  16. in the N-terminal section of the enzyme while the second is located in  the C-
  17. terminal section and seems to be part of the FAD-binding domain.
  18.  
  19. -Consensus pattern: [STA]-[LIVMSTA]-T-x(3)-[QR]-x-G-N-[PD]-x-P-R-[LIVMFYW]
  20. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  21. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  22.  
  23. -Consensus pattern: [LIVM](2)-G-x-G-G-[LIVM]-x-[ST]-x(3)-A-x(6)-G-A
  24. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  25. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  26.  
  27. -Last update: October 1993 / First entry.
  28.  
  29. [ 1] Nagy M., Lacroute F., Thomas D.
  30.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89:8966-8970(1992).
  31.